En cooperación con instituciones de Educación Superior, la Unesco promueve la instalación de Cátedras UNESCO y Redes Unitwin (University Twinning and Networking-Programa de Hermanamiento e Interconexión de Universidades), enfocadas en el estudio de temáticas vinculadas con las esferas de competencia de la organización, como la educación, las ciencias naturales y sociales, la cultura y la comunicación.

Las actividades de las Cátedras UNESCO abarcan la formación, investigación e intercambio de universitarios. Apuntan a tender puentes entre los círculos académicos, la sociedad civil, las comunidades locales, la investigación y la adopción de decisiones en materia de políticas, así como también impulsar la cooperación interuniversitaria internacional, la creación de redes, el intercambio de conocimientos y el trabajo colaborativo. La cátedras funcionan en más de 130 países.

Actualmente en la Udelar funcionan las siguientes Cátedras UNESCO:

Cátedra de Educación de Personas Jóvenes y Adultas

UNESCO y Udelar

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Cátedra de Carnaval y Patrimonio

UNESCO, Udelar e Intendencia de Montevideo

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Cátedra de Derechos Humanos

UNESCO y Udelar

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Cátedra en Manejo Costero Integrado del Cono Sur

UNESCO y Udelar

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Cátedra de Agua y Cultura

UNESCO y Udelar

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Cátedra en Geociencias de la Plataforma Costera y Continental 

UNESCO y Udelar

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