La Comisión Coordinadora del Interior fue creada por el Consejo Directivo Central (CDC) en diciembre de 2004 bajo el nombre de Comisión Gestora de Descentralización y comenzó a operar en febrero de 2005. El 17 de julio de 200, el CDC acordó convertirla en la Comisión Coordinadora del Trabajo de la Universidad de la República en el Interior, cuya denominación abreviada sería desde entonces Comisión Coordinadora del Interior (CCI).
Su principal objetivo es desarrollar y consolidar la presencia de la Udelar en el Interior, a partir de las sedes existentes, la creación de otras y la conformación de un nuevo tipo de servicio universitario (Centro Universitario Regional). Buscando revertir las inequidades geográficas, la pertinencia de las actividades académicas para la región, facilitando mayores niveles de inclusión social, democratizando el acceso a la educación terciaria en el interior del país.
Está integrada por un Plenario, conformado por el presidente de CCI, designado por el CDC, delegados de los Órdenes Universitarios, de las Áreas, de las sedes universitarias del interior y de los funcionarios TAS (titulares y alternos en cada caso). Por una Unidad de Apoyo Académico y una Unidad de Apoyo Administrativo.
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